大豆肽生產方法主要有酶解法、發酵法，目前作為食品配料的大豆肽主要采用酶解法制備。
酶解法制備大豆肽的過程中在選擇好原料以后，需要進行預處理在進行酶解。
底物在酶解前通過物理手段（高溫、高壓、超聲波等）適當變性，釋放酶切位點，為后續高效酶解提供基礎。
目前國內大豆肽制備的常用預處理工藝為：按照底物量加入適當比例的凈化水（純水、軟水等），通過剪切、攪拌等處理以達到分散均勻，并可升溫至80-100℃保溫5-30min，一方面起到殺菌作用，減少后續長時間酶解反應過程中產生的微生物腐敗現象，另一方面適當變性底物，然后冷切至初始酶解溫度。
酶解過程中工藝參數主要包括酶的選擇、酶用量、酶解方法、酶解溫度、pH值、酶解終點判定、滅酶等。
酶的選擇對酶解效率、大豆肽的品質（肽段、氨基酸組成、風味等）以及得率至關重要，通常采用多種酶組合以保證酶解效率。
注意使用的酶必須是GB2760規定的食用蛋白酶。
酶解方法包括同步酶解法、分步酶解法、酶膜反應器法。
酶解溫度和pH值的選擇取決于酶組合中各單酶的適宜作用溫度和pH值。